Вы можете установить какая версия считается основной (HTTP или HTTPS) с помощью тега rel="canonical", или создайте отдельный файл robots_ssl.txt, содержащий правила индексирования защищенных страниц вашего сайта.
Если HTTP и HTTPS версии вашего сайта не настроены правильно, обе версии могут быть проиндексированы поисковыми системами, что приведет к проблемам с дублирующимся контентом. Чтобы исправить это, рекомендуется установить одну версию (HTTP или HTTPS, в зависимости от содержимого на странице) в качестве приоритетной.